... nach Segemehl bin ich auf http://omictools.com/ gestoßen und von dort mal wieder bei Staden gelandet. Auf der Suche nach einer Anleitung für Staden fand ich dann Sammlung von Anleitungen und auch SeqMonk.
Bei SeqMonk scheint es sich um eine interessante Alternative zu anderen NGS Analysewerkzeugen zu handeln. Das Programm läuft gut unter Windo$ und hat eine klare Oberfläche. Eine gute Einführung wird in den Videos zum Programm gegeben. Mal sehen, ob sich das Programm im Neisseria-Projekt verwenden läßt.